Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms