Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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