Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ARXQ96QS3 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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