Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms