Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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GRIK5Q16478 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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