Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HMGN3Q15651 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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