Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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