Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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NFIXQ14938 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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NFIXQ14938 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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NFIXQ14938 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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