Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQLEQ14534 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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