Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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