Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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