Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms