Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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