Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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BFSP2Q13515 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BFSP2Q13515 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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