Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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