Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
SRSF5Q13243 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SRSF5Q13243 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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