Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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