Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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