Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SMARCB1Q12824 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCB1Q12824 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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