Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CASQ1P31415 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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