Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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