Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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CLDN9O95484 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLDN9O95484 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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