Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP35Q9P2H5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP35Q9P2H5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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