Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSF1Q96T23 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RSF1Q96T23 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSF1Q96T23 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSF1Q96T23 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSF1Q96T23 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms