Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBPF4Q96M43 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF4Q96M43 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms