Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEO1Q92859 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEO1Q92859 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms