Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP4Q8N2S1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms