Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf18Q8BM39 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms