Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms