Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR3Q6ZT12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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