Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms