Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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