Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP1BQ14684 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP1BQ14684 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
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