Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SREBF2Q12772 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SREBF2Q12772 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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