Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A2Q01362 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms