Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG7P83436 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG7P83436 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG7P83436 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG7P83436 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG7P83436 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG7P83436 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG7P83436 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG7P83436 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms