Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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PTPRMP28827 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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PTPRMP28827 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
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PTPRMP28827 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRMP28827 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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PTPRMP28827 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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PTPRMP28827 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
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PTPRMP28827 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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PTPRMP28827 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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