Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FGFR4P22455 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGFR4P22455 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms