Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB1P08034 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB1P08034 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB1P08034 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms