Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPA1O75762 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms