Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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