Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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