Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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