Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PHF12Q96QT6 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms