Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms