Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNCBQ16143 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNCBQ16143 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNCBQ16143 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNCBQ16143 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNCBQ16143 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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