Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC1Q15751 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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