Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SYCP1Q15431 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYCP1Q15431 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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