Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPRKQ15262 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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