Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB3GAP1Q15042 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms